《營業稅組織法》和《營業稅組織法法律法規》(以下簡稱《新章程》)將于2009年1月底實施。新章程對營業稅繳納的范圍、方式、周、地等做出了詳細、明確的規定。與修訂前的法律法規相比，突出的變化是取消總承包商的代扣代繳責任，配合建筑法的實施，取消分包工程的納稅問題，明確勞務發生項目的納稅申報，繼續執行總承包商營業收入扣除分包給其他單位的款項后的銷售金額，即利息納稅。地勘建設項目往往不在政府機構所在地的區劃內，營業稅是地方稅。由于市場上大多數個人利益的競爭，分包項目的稅收在實踐中往往成為一個難題。新章程實施以來，特別是總承包商代扣代繳責任取消后，總承包商如何異地核定納稅，即同時要提交哪些資料，辦理哪些手續，各地理解不同，執行時間尺度不同，使納稅有被嘲諷的感覺。
一是修訂前的營業稅章程明確規定了工程分包營業稅的繳納
根據修訂后的營業稅組織法的明確規定，紡織總承包方將項目分包或轉讓給浙江財稅網給他人，項目總承包額減去支付給分包方或分包方的價款即為銷售額。即只有分包的，總承包單位以合同總額減去支付給分包商的價款計算繳納營業稅，分包商對分包金額承擔相應的納稅義務。同時，浙江省財稅網根據明確規定，總承包商屬于法定代扣代繳納稅人。在與分包商結算竣工工程價款時，還應根據與分包商結算的工程價款計算并代扣其營業稅。分包商的營業稅代扣代繳后，總包商應及時向分包商開具代扣代收稅款匯票，分包商應將其作為其完稅匯票。
根據營業稅組織法的明確規定，建筑安裝業務分包或者轉包的，總承包人應當按照紡織營業稅的明確規定代扣代繳分包人或者分包人應繳納的營業稅，即大部分紡織營業稅代扣代繳。修改前的章程明確規定更為具體，易于操作。具體而言，跨政府機構所在地的區劃項目的分包或轉包，由項目所在地的扣繳義務人代扣代繳；非政府機構所在地的區劃項目分包或者轉包，由扣繳義務人在其政府機構所在地代扣代繳。浙江財稅網
會計上，分包工程營業稅等流轉稅由總承包商代扣代繳，由總承包商從各期分包進度款中扣除，該流轉稅構成分包商中小企業的營業稅及附加費；與浙江財稅網相關的流轉稅，是總承包商單獨完成的銷售的一部分，構成承包商中小企業的營業稅及附加費。
此外，如果建筑安裝工程總承包人為外國政府機構，且在全國范圍內沒有政府機構或全權經營管理，無論是分包還是轉包，所有項目應繳納的紡織營業稅均由建設項目單位代扣代繳。
第二，新的營業稅憲章明確規定了分包工程營業稅的繳納
新的公司章程對銷項稅、納稅、扣繳義務人等作出了詳細、明確的規定。其中，第五條第三款明確規定，項目在納稅后分包給其他單位的，其取得的總價和額外費用扣除支付給其他單位的分包款后的金額為銷售金額；第14條第1款明確規定，應稅勞務的稅款應提供給政府機構所在地或居住地的負責人
行政機關批準納稅。但中華人民共和國國務院稅收和財政提供的紡織勞務，
部門規定的其他應稅勞務，由主管應稅勞務的稅務機關審批；第十一條第一項、第二項，于無政府機構經營管理或全國無中間人者，指同稅勞工、資產移轉或資產出售。
扣繳義務人。
根據新的公司章程，總承包商和分包商應向其工作所在地的主管稅務機關審批納稅。金融機構在審批納稅時，應制定詳細的程序。但是因為
對于地方稅來說，大部分都是針對地方稅源的，操作方法不一樣。其中一些明確規定，無論是外出經營管理還是當地經營管理，都不得在政府機構所在地繳納，并設定另一個選民投票率，以阻礙擬議的納稅；勞務所在的金融機構是一個很簡單的要求，發票必須按票的金額支付。因此，應規范納稅行為和納稅方式。
對此，國稅部門應盡快制定綜合繳納辦法，完善擬建項目稅務機關備案制度或建設項目跟蹤制度，做到依法納稅，不漏繳稅款。
在稅務機關繼續推行統一支付方式之前，可以采用以下方式:
(1)無論承包還是分包工程，都必須在工程開工前簽訂協議，并盡可能完善建設工程程序。
(2)與政府機構所在地的財政部門大力溝通。簽訂協議后，到政府機構所在地的財政部門辦理出境經營管理許可證。
(3)項目開工前，務實地與項目所在地稅務機關聯系，并立即書面立案，介紹項目現狀，包括總承包商和分包商的名稱和價格，以及各種總承包合同和分包合同。
(4)最壞的情況是，分包商先開具單據并繳納稅款，取得分包商的完稅證明，然后總包商攜帶分包商的完稅證明到稅務機關繳稅。如果總承包人承擔了一個發包人100萬元的工程費用，分包金額60萬元，分包人將向總承包人繳納稅金并開具60萬元的工程費用發票，然后總承包人到財政縣市政府開具100萬元的工程造價文件并繳納利息稅。
需要明確的是，每個項目的總承包商和分包商的稅務機關必須完全一致。政府機構所在地的工程分包，要求分包商到總承包商的政府機構所在地辦理納稅審批。非政府組織所在地的項目分包需要分包商在項目所在地批準并納稅。地勘企業不能忽視價格較高、總值較低的小項目。比如物理工程項目價格不高，但是工程項目很多。除了改善合同信息外，此類項目最糟糕的方式是在總承包商政府機構所在地審批和納稅。